MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL2

Total Repeats: 549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009427	ATC	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009427	TTC	2	6	2592	2597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009427	GGC	2	6	2638	2643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009427	AACG	2	8	2647	2654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009427	GA	3	6	7213	7218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009427	CGT	2	6	7223	7228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009427	CGC	2	6	7276	7281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009427	CCGTC	2	10	7287	7296	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_009427	CGC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009427	TCG	2	6	7351	7356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009427	GCC	2	6	7359	7364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009427	GAGGT	2	10	7408	7417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009427	CTT	2	6	8346	8351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009427	GCG	2	6	8890	8895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009427	GGCG	2	8	8909	8916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009427	GTG	2	6	10757	10762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009427	TG	3	6	10765	10770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009427	CAT	2	6	12998	13003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009427	GGCG	2	8	17198	17205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009427	GC	3	6	19916	19921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009427	CGC	2	6	19935	19940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009427	CGG	2	6	21155	21160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009427	ACCG	2	8	21172	21179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009427	TCA	2	6	21186	21191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009427	CT	3	6	23450	23455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009427	TCGA	2	8	23516	23523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009427	CAA	2	6	23590	23595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009427	ACC	2	6	25703	25708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009427	GGCA	2	8	27289	27296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009427	CCG	2	6	27306	27311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_009427	CG	3	6	28490	28495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009427	TTG	2	6	30709	30714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009427	TC	3	6	33412	33417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009427	GCA	2	6	33454	33459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009427	T	6	6	33477	33482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009427	CCG	2	6	34952	34957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009427	GGC	2	6	37319	37324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009427	TCC	2	6	39798	39803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009427	CGT	2	6	39859	39864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009427	GCG	2	6	41081	41086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009427	CAC	2	6	43035	43040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009427	CAAT	2	8	43091	43098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009427	CTAT	2	8	43110	43117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009427	CGG	2	6	43917	43922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009427	CG	3	6	46084	46089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009427	AAC	2	6	46120	46125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009427	CG	3	6	46148	46153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009427	GC	3	6	46191	46196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009427	G	6	6	46324	46329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009427	AGG	2	6	46445	46450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009427	CCG	2	6	46739	46744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009427	CGG	2	6	46754	46759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009427	CGC	2	6	46764	46769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_009427	ACGGG	2	10	48549	48558	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009427	AAG	2	6	49176	49181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009427	CAC	2	6	49221	49226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009427	GCC	2	6	49313	49318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009427	TGG	2	6	49321	49326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009427	AGG	2	6	50179	50184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009427	GC	3	6	50200	50205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009427	GC	3	6	51085	51090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009427	GGAC	2	8	52648	52655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009427	GGA	2	6	52666	52671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009427	CGC	2	6	53170	53175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009427	CGA	2	6	55772	55777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009427	CGG	2	6	55782	55787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009427	TTCGC	2	10	55792	55801	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009427	TCC	2	6	58403	58408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009427	GAC	2	6	58984	58989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009427	CGG	2	6	60033	60038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009427	CCG	2	6	60395	60400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009427	TCCC	2	8	61209	61216	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_009427	GCGG	2	8	61253	61260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009427	CT	3	6	61698	61703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009427	GCC	2	6	61772	61777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009427	AAG	2	6	61786	61791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009427	GAC	2	6	65501	65506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009427	ATG	2	6	65513	65518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009427	C	6	6	65545	65550	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_009427	GC	4	8	65572	65579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009427	CAAT	2	8	65605	65612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009427	CCG	2	6	66060	66065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_009427	TTCGA	2	10	68461	68470	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009427	GCCCC	2	10	68538	68547	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
85	NC_009427	TCC	2	6	71057	71062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009427	GC	3	6	71079	71084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009427	CTG	2	6	71175	71180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009427	CGCC	2	8	73007	73014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_009427	CCG	2	6	73015	73020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009427	A	6	6	73804	73809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009427	AGGA	2	8	73817	73824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009427	TCCCC	2	10	73842	73851	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
93	NC_009427	C	6	6	73848	73853	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_009427	TCG	2	6	73873	73878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009427	CG	3	6	73877	73882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009427	TCC	2	6	76253	76258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_009427	ACGA	2	8	76282	76289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009427	GCT	2	6	76296	76301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009427	TCC	2	6	76306	76311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009427	GC	3	6	76356	76361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009427	TGC	2	6	76364	76369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009427	GATA	2	8	76377	76384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009427	TAT	2	6	79793	79798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009427	AT	3	6	79903	79908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009427	TA	3	6	79915	79920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009427	GCG	2	6	79992	79997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009427	GGA	2	6	80006	80011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009427	CGC	3	9	80061	80069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009427	GAG	2	6	80090	80095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009427	CGGA	2	8	80817	80824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009427	CTG	2	6	84324	84329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009427	GCGG	2	8	84343	84350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009427	GGC	3	9	85379	85387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009427	GCC	2	6	85405	85410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009427	CGG	2	6	85428	85433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009427	CTC	2	6	89527	89532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009427	GCA	2	6	89554	89559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009427	G	6	6	89568	89573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009427	CGC	2	6	89615	89620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009427	TGG	2	6	89623	89628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009427	CGGG	2	8	93676	93683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009427	CGG	2	6	94922	94927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009427	TCG	2	6	96119	96124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009427	GGCGGG	2	12	96131	96142	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009427	CGA	2	6	96161	96166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009427	GCA	2	6	101527	101532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009427	C	9	9	101547	101555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_009427	GC	3	6	101593	101598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009427	TCC	2	6	101600	101605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009427	CGA	4	12	101610	101621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009427	GC	3	6	109049	109054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009427	AGG	2	6	109055	109060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009427	C	6	6	111424	111429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NC_009427	ATG	3	9	117007	117015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009427	GGA	2	6	117074	117079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009427	TC	3	6	119606	119611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009427	ACG	2	6	119657	119662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009427	CAG	2	6	119684	119689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009427	GAC	2	6	124206	124211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009427	ACG	2	6	124297	124302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009427	ACGG	2	8	124343	124350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009427	GGC	2	6	125388	125393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009427	CGG	2	6	126175	126180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009427	GCG	2	6	131263	131268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009427	AATA	2	8	131279	131286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009427	CGC	2	6	131352	131357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_009427	GTG	2	6	131384	131389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009427	GC	3	6	131410	131415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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263	NC_009427	CGC	2	6	209403	209408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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281	NC_009427	CG	3	6	224803	224808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_009427	CGC	2	6	224811	224816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_009427	G	7	7	228496	228502	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_009427	GTCA	2	8	342850	342857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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